Мэлхий нинжанууд газар доорх хонгилдоо нуугдсан хэвээрээ л байлаа. April O’Neill эрдэмтэн Baxter-ыг мөрдөн, түүнийг Shredder-ийн доор ажилладаг нэгэн болохыг олж илрүүлдэг. Эрдэмтэн Baxter шоронд буй Shredder-ийг оргуулах төлөвлөгөө зохионо. Ингээд April эрдэмтний хорон төлөвлөгөө хэрэгжиж эхлэхээс өмнө мэлхий нинжануудад энэ талаар хэлэх ёстой байлаа. Shredder буцан хотод ирвэл ямар аюул дахин болох бол?